SMRTe Plasmide di attivazione CRISPR (h): sc-401150-ACT
- Specie Target: human
- 20 µg di DNA plasmidico purificato, pronto per trasfezione; sufficiente fino a 20 trasfezioni
- SMRTe Plasmide di attivazione CRISPR (h) è un mediatore sinergico di attivazione (SAM) del sistema di attivazione trascrizionale disegnato per upregolare specificatamente l'espressione genica
- SMRTe CRISPR Activation Plasmid (h) consiste di tre plasmidi in proporzione 1:1:1 : un plasmide che codifica la nucleasi (D10A and N863A) Cas9 (dCas9) deattivata fusa al dominio di transattivazione VP64, ed un gene di resistenza alla blasticina; un plasmide che codifica per la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, ed un gene di resistenza all'igromicina;un plasmide che codifica un RNA guida di 20 nt target specifico, e un gene di resistenza alla puromicina.
- Il complesso SAM legae una regione sito-specifica circa 200-250 nt a monte del sito di start trascrizionale e fornisce un robusto reclutamento di fattori trascrizionali per un'attivazione altamente efficiente del gene target
- I gRNA codificati dal SMRTe CRISPR Activation Plasmid (h) e dal SMRTe CRISPR Activation Plasmid (h2) prendono di mira regioni regolatorie distinte a monte del sito di inizio della trascrizione di NCOR2. Uno o entrambi i modelli potrebbero essere disponibili
- In seguito alla trasfezione, l'efficienza dll'attivazione genica può essere testata con WB, IF o IHC utilizzando l'anticorpo: SMRTe Antibody (1542/H7): sc-13554
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| Nome del prodotto | Codice del prodotto | UNITÀ | Prezzo | Quantità | Preferiti | |
SMRTe Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-401150-ACT | 20 µg | $397.00 |
NCOR2 codifica SMRTe (silencing mediator for retinoid and thyroid hormone receptors), un corepressore che funge da piattaforma per l’assemblaggio di complessi di repressione trascrizionale contenenti HDAC3 e altri fattori correlati di modifica della cromatina. Interagendo con i recettori nucleari e con ulteriori fattori di trascrizione, SMRTe contribuisce a coordinare la compattazione della cromatina e il silenziamento genico dipendente dal contesto in programmi genici sensibili agli ormoni e dello sviluppo. Questa regolazione si intreccia con vie che controllano le decisioni sul destino cellulare, l’omeostasi metabolica e la segnalazione infiammatoria, attraverso effetti estesi sull’acetilazione di enhancer e promotori. Un’attività deregolata di NCOR2/SMRTe è stata implicata in reti trascrizionali alterate osservate nella biologia dei tumori, in fenotipi correlati al sistema endocrino e in meccanismi di malattia immunomediati, sostenendone l’utilizzo come nodo meccanicistico negli studi di regolazione genica.
SMRTe Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di NCOR2 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
SMRTe Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus NCOR2 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione NCOR2, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di SMRTe. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus NCOR2 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da SMRTe nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via SMRTe nelle cellule tumorali con espressione di NCOR2 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.