SELENBP1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (m): sc-422870

Panoramica

Selenbp1 codifica la proteina 1 legante il selenio (SELENBP1), una proteina citosolica implicata nella gestione cellulare del selenio e nel metabolismo associato ai processi redox. Nei tessuti murini, SELENBP1 è collegata alla regolazione delle risposte allo stress ossidativo e all’adattamento metabolico, con connessioni riportate al processamento degli xenobiotici e ai programmi di differenziamento cellulare. Un’alterata abbondanza di SELENBP1 è stata associata a variazioni della proliferazione e della segnalazione dello stress in molteplici sistemi sperimentali, rendendola rilevante per lo studio di fenotipi metabolici e redox dipendenti dal contesto. In quanto fattore associato al selenio, SELENBP1 rappresenta un nodo sperimentalmente accessibile per chiarire come l’utilizzo del selenio si integri con le vie omeostatiche che influenzano la fitness cellulare.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO SELENBP1 (m) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene Selenbp1 in linee cellulari mouse. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del Selenbp1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto Selenbp1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina SELENBP1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di Selenbp1 per lo studio della segnalazione di SELENBP1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni Selenbp1 critici per la funzione di SELENBP1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di Selenbp1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal SELENBP1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m) e dal SELENBP1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus Selenbp1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal SELENBP1 Plasmide HDR (m) e il plasmide HDR SELENBP1 (m2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia Selenbp1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio Selenbp1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.