SCML1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-407161

Panoramica

SCML1 (sex comb on midleg-like 1) codifica una proteina associata al gruppo Polycomb, implicata nella repressione trascrizionale dipendente dalla cromatina e nel mantenimento degli stati epigenetici. In quanto membro della famiglia SCM, SCML1 è collegata alla biologia dei complessi repressivi Polycomb, contribuendo alla regolazione dei programmi di espressione genica guidata da marcatori istonici che influenzano l’identità cellulare e i processi di sviluppo. Un’attività alterata della via Polycomb è ampiamente rilevante per la differenziazione disregolata e lo squilibrio trascrizionale a livello dell’intero genoma osservati in molteplici contesti patologici, rendendo SCML1 un nodo utile per studiare i meccanismi di controllo epigenetico. Lo studio di SCML1 supporta la ricerca sull’organizzazione della cromatina, sul silenziamento trascrizionale e sugli effetti a valle sulle reti geniche specifiche di linea.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO SCML1 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene SCML1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del SCML1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto SCML1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina SCML1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di SCML1 per lo studio della segnalazione di SCML1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni SCML1 critici per la funzione di SCML1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di SCML1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal SCML1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal SCML1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus SCML1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal SCML1 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR SCML1 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia SCML1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio SCML1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.