RNPS1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (m): sc-422692

Panoramica

Rnps1 del topo codifica RNPS1, una proteina conservata legante l’RNA che svolge un ruolo nello splicing del pre‑mRNA e nella sorveglianza degli mRNP dopo lo splicing. RNPS1 partecipa a processi associati al complesso di giunzione degli esoni (exon junction complex) e supporta la degradazione dell’mRNA mediata da codoni di stop prematuri (nonsense‑mediated mRNA decay, NMD), influenzando il controllo qualità dei trascritti, l’esportazione dell’mRNA e la competenza traduttiva. Attraverso queste attività, RNPS1 contribuisce a mantenere l’integrità del proteoma e regola programmi di espressione genica legati alla progressione del ciclo cellulare e alle risposte allo stress. La disregolazione delle vie di splicing e di sorveglianza dell’mRNA è ampiamente implicata in fenotipi del neurosviluppo e nel rimodellamento del trascrittoma associato al cancro, rendendo RNPS1 un nodo utile per studi meccanicistici della processazione dell’RNA.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO RNPS1 (m) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene Rnps1 in linee cellulari mouse. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del Rnps1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto Rnps1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina RNPS1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di Rnps1 per lo studio della segnalazione di RNPS1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni Rnps1 critici per la funzione di RNPS1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di Rnps1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal RNPS1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m) e dal RNPS1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus Rnps1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal RNPS1 Plasmide HDR (m) e il plasmide HDR RNPS1 (m2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia Rnps1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio Rnps1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.