PTPN21 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-407466

Panoramica

PTPN21 codifica una fosfatasi tirosinica proteica citosolica che modula la segnalazione dipendente dalla fosforilazione defosforilando substrati specifici e proteine scaffold. Attraverso la regolazione degli output delle tirosin-chinasi recettoriali e delle vie a valle che controllano la dinamica del citoscheletro, l’adesione e il traffico vescicolare, PTPN21 può influenzare la motilità cellulare e l’ampiezza del segnale. La sua attività si intreccia con reti che governano le risposte ai fattori di crescita e la segnalazione da stress, rendendola rilevante per studi sulla trasformazione cellulare e sui fenotipi invasivi. Una segnalazione fosfatasica deregolata che coinvolge PTPN21 è stata implicata in contesti quali il rimodellamento della segnalazione associato al cancro e alterazioni del comportamento migratorio.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO PTPN21 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene PTPN21 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del PTPN21 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto PTPN21 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina PTPN21.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di PTPN21 per lo studio della segnalazione di PTPN21, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni PTPN21 critici per la funzione di PTPN21
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di PTPN21 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal PTPN21 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal PTPN21 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus PTPN21. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal PTPN21 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR PTPN21 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia PTPN21 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio PTPN21 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.