Non dati CRISPR: l'immagine illustra la qualità degli anticorpi per la visualizzazione dei risultati degli esperimenti CRISPR.
Non dati CRISPR: l'immagine illustra la qualità degli anticorpi per la visualizzazione dei risultati degli esperimenti CRISPR.
PRDM8 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-406359
- Specie Target: human
- 20 µg di DNA plasmidico purificato, pronto per trasfezione; sufficiente fino a 20 trasfezioni
- PRDM8 Il plasmide CRISPR/Cas9 Knockout (KO) (h) è un pool di plasmidi, ciascuno dei quali codifica la nucleasi Cas9 e un RNA guida (gRNA) specifico per il bersaglio di 20 nt, progettato per la massima efficienza di knockout utilizzando sequenze derivate dalla libreria GeCKO v2
- Le sequenze gRNA indirizzano Cas9 a indurre rotture a doppio filamento (DSB) sito-specifiche nel locus genomico PRDM8, con conseguente knockout genico tramite giunzione non omologa (NHEJ)
- I geni di resistenza alla puromicina e RFP sono fiancheggiati da siti LoxP, consentendo la rimozione dei marcatori di selezione tramite la ricombinasi Cre (Cre Vector: sc-418923) dopo aver stabilito linee cellulari knockout stabili
- In seguito alla trasfezione, l'efficienza dll'attivazione genica può essere testata con WB, IF o IHC utilizzando l'anticorpo: PRDM8 Antibody (E-3): sc-390001
Informazioni ordini
| Nome del prodotto | Codice del prodotto | UNITÀ | Prezzo | Quantità | Preferiti | |
PRDM8 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h) | sc-406359 | 20 µg | $397.00 |
Panoramica
PRDM8 (PR/SET domain 8) codifica un regolatore trascrizionale contenente un dominio PR/SET che influenza lo stato della cromatina e i programmi di espressione genica durante lo sviluppo. In quanto membro della famiglia PRDM, PRDM8 è associato a meccanismi di controllo epigenetico che modellano la differenziazione neuronale, la guida assonale e, più in generale, reti trascrizionali specifiche di linea cellulare. Un’alterata regolazione delle vie associate a PRDM8 può perturbare le decisioni di destino cellulare ed è stata studiata nel contesto della disfunzione neurosviluppativa e della disregolazione trascrizionale osservata in paesaggi epigenetici rilevanti per il cancro. Lo studio di PRDM8 supporta l’analisi meccanicistica della repressione/attivazione mediata dalla cromatina, del controllo enhancer–promoter e degli effetti a valle su proliferazione e differenziazione.
Il plasmide CRISPR/Cas9 KO PRDM8 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene PRDM8 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del PRDM8 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.
Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto PRDM8 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina PRDM8.
Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di PRDM8 per lo studio della segnalazione di PRDM8, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.
Caratteristiche principali
- sgRNA mirati agli esoni PRDM8 critici per la funzione di PRDM8
Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di PRDM8 per migliorare l'efficienza del knockout
Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione
Varianti di progettazione
CRISPR +/- HDR
- Gli gRNA codificati dal PRDM8 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal PRDM8 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus PRDM8. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
I costrutti donatori HDR codificati dal PRDM8 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR PRDM8 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia PRDM8 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio PRDM8 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.