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Paraxis Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-403926-ACT | 20 µg | $397.00 |
Il TCF15 umano codifica Paraxis, un fattore di trascrizione basic helix–loop–helix che orchestra il patterning del mesoderma paraassiale e la compartimentalizzazione dei somiti durante l’embriogenesi. Paraxis regola programmi di linea cellulare che governano la differenziazione miogenica e condrogenica, coordinando reti trascrizionali coinvolte nell’epitelializzazione, nell’impegno del destino cellulare e nella morfogenesi dei tessuti. Grazie al suo ruolo nella regolazione genica dello sviluppo, TCF15 viene studiato in vie che plasmano la formazione muscoloscheletrica e in modelli di stati di differenziazione aberranti rilevanti per difetti congeniti dello sviluppo e per la riprogrammazione trascrizionale associata al cancro. Un’espressione deregolata di TCF15 è stata riportata in molteplici contesti tumorali, favorendone l’uso come nodo per analizzare il controllo trascrizionale specifico del contesto e le transizioni dell’identità cellulare.
Paraxis Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di TCF15 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
Paraxis Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus TCF15 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione TCF15, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di Paraxis. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus TCF15 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da Paraxis nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via Paraxis nelle cellule tumorali con espressione di TCF15 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.