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PABP Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-400688-ACT | 20 µg | $397.00 |
La PABPC1 umana codifica la proteina legante la poli(A) (PABP), un regolatore centrale del metabolismo dell’mRNA citoplasmatico che si lega alle code poli(A) 3′ per favorire l’inizio della traduzione e stabilizzare i trascritti. Attraverso interazioni con i fattori di inizio della traduzione e con componenti del macchinario di degradazione dell’mRNA, PABP coordina la circolarizzazione dell’mRNA, l’efficienza traduttiva e il turnover dipendente dalla deadenilazione. PABPC1 contribuisce inoltre alla dinamica dei granuli da stress e dei processing bodies, collegando il controllo della traduzione alle risposte cellulari allo stress. Un’alterata attività di PABP e l’espressione di PABPC1 sono state associate a programmi di espressione genica deregolati osservati nel cancro e nelle interazioni virus–ospite, rendendola rilevante per studi sulla segnalazione oncogenica e sulla modulazione dell’immunità innata.
PABP Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di PABPC1 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
PABP Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus PABPC1 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione PABPC1, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di PABP. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus PABPC1 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da PABP nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via PABP nelle cellule tumorali con espressione di PABPC1 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.