Date published: 2025-9-7

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Oct-1 Gel Shift Oligonucleotides: sc-2506

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Schede Tecniche
  • consensus binding site for Oct family homeodomain transcription factors; supplied as 500 ng double-stranded DNA; sc-2506
  • also available as mutant oligonucleotide with an "AT"→"GC" substitution in Oct DNA binding motif; sc-2515
  • 5′-TGT CGA ATG CAA ATC ACT AGA A-3′

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Gli oligonucleotidi Oct-1 Gel Shift sono brevi sequenze di DNA progettate per essere utilizzate nei saggi di gel shift, una tecnica fondamentale in biologia molecolare utilizzata per studiare le interazioni proteina-DNA. Questi oligonucleotidi sono derivati dalla sequenza di legame consensuale del fattore di trascrizione Oct-1, che appartiene alla famiglia dei fattori di trascrizione con dominio POU (Pit-Oct-Unc). Oct-1 svolge un ruolo cruciale nella regolazione dell'espressione genica legandosi a specifiche sequenze di DNA, note come motivi ottamici, situate all'interno dei promotori dei geni bersaglio. Quando si lega ai suoi siti bersaglio, Oct-1 può attivare o reprimere la trascrizione genica, a seconda del contesto e della sua interazione con altre proteine regolatrici. Utilizzando gli oligonucleotidi Oct-1 Gel Shift nei saggi Gel Shift, i ricercatori possono studiare la cinetica di legame, la specificità e l'affinità di Oct-1 ai motivi ottamici in varie condizioni sperimentali. Questa tecnica consente di chiarire i meccanismi molecolari alla base della regolazione genica mediata da Oct-1 e fornisce indicazioni sulle complesse reti di segnalazione che regolano processi cellulari come lo sviluppo, il differenziamento e la proliferazione.

Riferimenti:

  1. Il fattore di trascrizione octamer-1 aumenta l'attivazione mediata dal fattore nucleare epatico-1alfa del promotore dell'UDP glucuronosiltransferasi 2B7 umana.  |  Ishii, Y., et al. 2000. Mol Pharmacol. 57: 940-7. PMID: 10779377
  2. Legame allele-specifico del fattore di trascrizione ubiquitario OCT-1 ai siti funzionali di polimorfismo a singolo nucleotide (SNP) nel promotore del gene del fattore di necrosi tumorale-alfa (TNFA).  |  Hohjoh, H. and Tokunaga, K. 2001. Genes Immun. 2: 105-9. PMID: 11393654
  3. Legame dei fattori ottamici alla IL-5 CLE0 murina in cellule T primarie e in una linea di cellule T.  |  Salerno, MS., et al. 2001. Cytokine. 15: 4-9. PMID: 11509003
  4. Gli inibitori della 3-idrossi-3-metilglutaril coenzima A reduttasi aumentano l'attività di legame e il livello nucleare di Oct-1 nelle cellule mononucleari.  |  Ortego, M., et al. 2002. Eur J Pharmacol. 448: 113-21. PMID: 12144930
  5. Coinvolgimento di Oct-1 nella regolazione trascrizionale dell'espressione del gene della beta-caseina nella ghiandola mammaria di topo.  |  Zhao, FQ., et al. 2002. Biochim Biophys Acta. 1577: 27-37. PMID: 12151092
  6. Le proteine omeodome TALE regolano l'espressione genica dell'ormone di rilascio delle gonadotropine in modo indipendente e attraverso interazioni con Oct-1.  |  Rave-Harel, N., et al. 2004. J Biol Chem. 279: 30287-97. PMID: 15138251
  7. Oct-1 e il fattore nucleare Y si legano all'elemento SURG-1 per dirigere la trascrizione del gene del recettore GnRH di topo al basale e stimolato dall'ormone di rilascio delle gonadotropine (GnRH).  |  Kam, KY., et al. 2005. Mol Endocrinol. 19: 148-62. PMID: 15388790
  8. Il triptolide, un componente attivo del rimedio erboristico cinese Tripterygium wilfordii Hook F, inibisce la produzione di ossido nitrico diminuendo la trascrizione del gene dell'ossido nitrico sintasi inducibile.  |  Wang, B., et al. 2004. Arthritis Rheum. 50: 2995-303. PMID: 15457469
  9. Regolazione del promotore del gene CYP4A2 di ratto da parte di c-Jun e della octamer binding protein-1.  |  Fiala-Beer, E., et al. 2007. Int J Biochem Cell Biol. 39: 1235-47. PMID: 17481938
  10. Associazione della concentrazione di interleuchina-6 nel siero con un polimorfismo funzionale IL6 -6331T>C.  |  Smith, AJ., et al. 2008. Clin Chem. 54: 841-50. PMID: 18356242
  11. La laminina B1 controlla le risposte allo stress ossidativo attraverso Oct-1.  |  Malhas, AN., et al. 2009. J Cell Biol. 184: 45-55. PMID: 19139261
  12. Un motivo Oct-1 far-upstream regola la trascrizione indotta da citochine del gene dell'ossido nitrico sintasi inducibile umano.  |  Park, KS., et al. 2009. J Mol Biol. 390: 595-603. PMID: 19467240
  13. L'attività trascrizionale dell'enhancer del papillomavirus umano di tipo 31b è regolata attraverso l'interazione sinergica di AP1 con due nuovi fattori cellulari.  |  Kyo, S., et al. 1995. Virology. 211: 184-97. PMID: 7645210
  14. Oct-1 lega gli elementi del promotore necessari per la trascrizione del gene GnRH.  |  Eraly, SA., et al. 1998. Mol Endocrinol. 12: 469-81. PMID: 9544983

Informazioni ordini

Nome del prodottoCodice del prodottoUNITÀPrezzoQuantitàPreferiti

Oct-1 consensus oligonucleotide

sc-2506
500 ng/25 µl
$49.00

Oct-1 mutant oligonucleotide

sc-2515
500 ng/25 µl
$49.00