Gli oligonucleotidi NF-1 Gel Shift sono brevi sequenze di DNA meticolosamente progettate per l'uso nei saggi Gel Shift, una tecnica fondamentale nella ricerca in biologia molecolare utilizzata per studiare le interazioni proteina-DNA. Il nome "NF-1" corrisponde al fattore nucleare 1 (NF-1), un fattore di trascrizione riconosciuto per il suo ruolo centrale nella regolazione dell'espressione genica e dei processi cellulari come lo sviluppo, la differenziazione e la proliferazione. L'NF-1 si lega a specifiche sequenze di DNA, note come siti di legame dell'NF-1, all'interno dei promotori e degli esaltatori dei geni bersaglio, modulando così la loro attività trascrizionale. Utilizzando gli oligonucleotidi NF-1 Gel Shift nei saggi di gel shift, i ricercatori esplorano la cinetica di legame, la specificità e l'affinità di NF-1 ai siti di legame di NF-1 in varie condizioni sperimentali. Questa tecnica consente di chiarire i meccanismi molecolari alla base della regolazione genica mediata da NF-1 e fornisce indicazioni sulle reti di segnalazione che regolano i processi cellulari.
Riferimenti:
- Regolazione trascrizionale dell'espressione specifica del tipo di cellula del gene della subunità A senza TATA del fattore XIII della coagulazione umana. | Kida, M., et al. 1999. J Biol Chem. 274: 6138-47. PMID: 10037697
- Caratterizzazione biochimica di un fattore nucleare che si lega a elementi simili a NF1 nel promotore di p53 nel ratto. | Lee, M., et al. 2000. J Cell Biochem. 78: 1-7. PMID: 10797561
- Un sito funzionale di legame di NF-kappaB nella regione di controllo lunga del papillomavirus umano di tipo 16. | Fontaine, V., et al. 2000. Virology. 272: 40-9. PMID: 10873747
- Regolazione trascrizionale del promotore basale della cistationina beta-sintasi -1b umana: transattivazione sinergica da parte dei fattori di trascrizione NF-Y e Sp1/Sp3. | Ge, Y., et al. 2001. Biochem J. 357: 97-105. PMID: 11415440
- Regolazione trascrizionale del gene della leucina aminopeptidasi/ossitocina placentare umana. | Ito, T., et al. 2001. Mol Hum Reprod. 7: 887-94. PMID: 11517297
- Caratterizzazione del promotore della catepsina L umana e identificazione dei siti di legame per NF-Y, Sp1 e Sp3, essenziali per la sua attività. | Jean, D., et al. 2002. Biochem J. 361: 173-84. PMID: 11742542
- La polvere organica attiva NF-kappaB nelle cellule epiteliali polmonari. | Lidén, J., et al. 2003. Respir Med. 97: 882-92. PMID: 12924514
- L'aumento della funzione promotrice della citocromo P450 17alfa-idrossilasi nelle cellule teca isolate da pazienti con sindrome dell'ovaio policistico coinvolge il fattore nucleare-1. | Wickenheisser, JK., et al. 2004. Mol Endocrinol. 18: 588-605. PMID: 14684846
- Analisi genetica e biochimica degli elementi regolatori cis all'interno della regione enhancer cheratinocitaria della regione regolatrice upstream del papillomavirus umano di tipo 31 durante le diverse fasi del ciclo di vita virale. | Sen, E., et al. 2004. J Virol. 78: 612-29. PMID: 14694093
- Il gene dell'involucrina umana è trascrizionalmente represso attraverso un elemento silenziatore tessuto-specifico riconosciuto da Oct-2. | Azuara-Liceaga, E., et al. 2004. Biochem Biophys Res Commun. 318: 361-71. PMID: 15120610
- La pentossifillina, la pentifillina e gli interferoni diminuiscono i livelli di mRNA del procollagene di tipo I e III nei fibroblasti dermici: evidenza della mediazione della down-regulation del fattore nucleare 1. | Duncan, MR., et al. 1995. J Invest Dermatol. 104: 282-6. PMID: 7530274
- Regolazione da parte del fattore di crescita trasformante-beta 1 della trascrizione del gene della sialoproteina ossea: identificazione di un elemento di attivazione del TGF-beta nel promotore del gene BSP del ratto. | Ogata, Y., et al. 1997. J Cell Biochem. 65: 501-12. PMID: 9178100
- Meccanismi nella regolazione trascrizionale dell'espressione genica del recettore B1 della bradichinina. Identificazione di un enhancer minimo specifico per ogni tipo di cellula. | Yang, X., et al. 1998. J Biol Chem. 273: 10763-70. PMID: 9553142
- Domini multipli per le proteine di legame dell'iniziatore TFII-I e YY-1 sono presenti nelle regioni iniziatrici e a monte del promotore XDH/XO TATA-less di ratto. | Clark, MP., et al. 1998. Nucleic Acids Res. 26: 2813-20. PMID: 9592172
- Attivazione trascrizionale del gene del procollagene alfa1(I) e up-regolazione dell'RNA messaggero del procollagene alfa1(I) e alfa1(III) in fibroblasti dermici di topi 'tight skin 2'. | Christner, PJ., et al. 1998. Arthritis Rheum. 41: 2132-42. PMID: 9870870