MTA1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-400942

Panoramica

MTA1 (metastasis associated 1) codifica un coregolatore associato alla cromatina e un componente chiave del complesso NuRD (nucleosome remodeling and deacetylase), integrando il rimodellamento dei nucleosomi dipendente dall’ATP con la deacetilazione degli istoni per modellare i programmi trascrizionali. Attraverso interazioni con HDAC1/2, CHD4 e fattori di trascrizione specifici di sequenza, MTA1 influenza la transizione epitelio-mesenchimale, le risposte al danno al DNA, la segnalazione dei recettori ormonali e la regolazione del ciclo cellulare. Alterazioni dell’espressione o dell’attività di MTA1 sono state collegate alla progressione tumorale e a fenotipi invasivi in molteplici tipi di cancro, dove può modulare vie oncogeniche e di differenziamento. In quanto regolatore nucleare dello stato della cromatina, MTA1 è spesso studiato nelle dinamiche di repressione/attivazione trascrizionale, nella plasticità epigenetica e nei meccanismi dell’espressione genica associata alla metastasi.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO MTA1 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene MTA1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del MTA1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto MTA1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina MTA1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di MTA1 per lo studio della segnalazione di MTA1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni MTA1 critici per la funzione di MTA1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di MTA1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal MTA1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal MTA1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus MTA1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal MTA1 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR MTA1 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia MTA1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio MTA1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.