IRF-1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (r): sc-437365

Panoramica

Il fattore regolatore dell’interferone 1 (IRF-1) è un fattore di trascrizione che si lega al DNA e che integra segnali di interferone, citochine e rilevamento dei patogeni per modellare i programmi genici dell’immunità innata e adattativa nelle cellule di ratto. IRF-1 regola reti trascrizionali che controllano la presentazione dell’antigene, la produzione di mediatori infiammatori e le risposte antivirali, interfacciandosi con la segnalazione JAK/STAT e con il cross-talk con vie dipendenti da NF-κB. Attraverso i suoi ruoli nel controllo del ciclo cellulare e nell’apoptosi, IRF-1 influenza gli esiti della risposta allo stress e la differenziazione delle cellule immunitarie. Un’attività alterata di IRF-1 è stata associata a infiammazione disregolata e a fenotipi di difesa dell’ospite alterati, a supporto del suo impiego come nodo meccanicistico in modelli di immunologia e infezione.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO IRF-1 (r) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene in linee cellulari rat. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina IRF-1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di per lo studio della segnalazione di IRF-1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni critici per la funzione di IRF-1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal IRF-1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (r) e dal IRF-1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (r2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus . Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal IRF-1 Plasmide HDR (r) e il plasmide HDR IRF-1 (r2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.