Not CRISPR data: the image illustrates antibody quality for visualizing CRISPR experiment results.
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HS6ST1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-405111
- Specie Target: human
- 20 µg di DNA plasmidico purificato, pronto per trasfezione; sufficiente fino a 20 trasfezioni
- HS6ST1 Il plasmide CRISPR/Cas9 Knockout (KO) (h) è un pool di plasmidi, ciascuno dei quali codifica la nucleasi Cas9 e un RNA guida (gRNA) specifico per il bersaglio di 20 nt, progettato per la massima efficienza di knockout utilizzando sequenze derivate dalla libreria GeCKO v2
- Le sequenze gRNA indirizzano Cas9 a indurre rotture a doppio filamento (DSB) sito-specifiche nel locus genomico HS6ST1, con conseguente knockout genico tramite giunzione non omologa (NHEJ)
- I geni di resistenza alla puromicina e RFP sono fiancheggiati da siti LoxP, consentendo la rimozione dei marcatori di selezione tramite la ricombinasi Cre (Cre Vector: sc-418923) dopo aver stabilito linee cellulari knockout stabili
- In seguito alla trasfezione, l'efficienza dll'attivazione genica può essere testata con WB, IF o IHC utilizzando l'anticorpo: HS6ST1 Antibody (C-9): sc-398231
Informazioni ordini
| Nome del prodotto | Codice del prodotto | UNITÀ | Prezzo | Quantità | Preferiti | |
HS6ST1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h) | sc-405111 | 20 µg | $397.00 |
Panoramica
HS6ST1 codifica l’eparan solfato 6-O-solfotransferasi 1, un enzima residente nel Golgi che catalizza la 6-O-solfatazione dei residui di glucosamina durante la maturazione dei proteoglicani a eparan solfato. Questa modificazione modella i siti di legame dell’eparan solfato che controllano la distribuzione e la potenza di segnalazione di molteplici morfogeni e fattori di crescita, influenzando processi quali la segnalazione mediata da recettori tirosin-chinasici, le interazioni cellula–matrice e la definizione dei pattern di sviluppo. Regolando finemente la struttura dell’eparan solfato, HS6ST1 può modulare in modo dipendente dal contesto vie che includono la segnalazione FGF, WNT, BMP e Hedgehog. Programmi alterati di solfatazione dell’eparan solfato che coinvolgono HS6ST1 sono stati associati a una comunicazione cellulare disregolata nella biologia dei tumori e a fenotipi di neuro-sviluppo, rendendolo un nodo utile per studi meccanicistici sulla regolazione della segnalazione extracellulare.
Il plasmide CRISPR/Cas9 KO HS6ST1 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene HS6ST1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del HS6ST1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.
Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto HS6ST1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina HS6ST1.
Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di HS6ST1 per lo studio della segnalazione di HS6ST1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.
Caratteristiche principali
- sgRNA mirati agli esoni HS6ST1 critici per la funzione di HS6ST1
Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di HS6ST1 per migliorare l'efficienza del knockout
Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione
Varianti di progettazione
CRISPR +/- HDR
- Gli gRNA codificati dal HS6ST1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal HS6ST1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus HS6ST1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
I costrutti donatori HDR codificati dal HS6ST1 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR HS6ST1 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia HS6ST1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio HS6ST1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.