hnRNP UL1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (m): sc-433226

Panoramica

Il gene murino **Hnrnpul1** codifica **hnRNP UL1**, una proteina nucleare legante l’RNA che si associa a complessi ribonucleoproteici per coordinare l’elaborazione del pre-mRNA, il trasporto dell’RNA e programmi più ampi di espressione genica. hnRNP UL1 è stato inoltre collegato alle risposte al danno del DNA attraverso interazioni con fattori associati alla riparazione, contribuendo al mantenimento del genoma durante lo stress replicativo. Attraverso questi ruoli, Hnrnpul1 può influenzare vie che regolano la maturazione dell’RNA, i processi associati alla cromatina e la progressione del ciclo cellulare. La regolazione alterata dei membri della famiglia hnRNP è spesso oggetto di studio in contesti di instabilità genomica e di controllo deregolato del trascrittoma, rilevanti per la biologia del cancro e per fenotipi dello sviluppo.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO hnRNP UL1 (m) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene Hnrnpul1 in linee cellulari mouse. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del Hnrnpul1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto Hnrnpul1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina hnRNP UL1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di Hnrnpul1 per lo studio della segnalazione di hnRNP UL1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni Hnrnpul1 critici per la funzione di hnRNP UL1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di Hnrnpul1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal hnRNP UL1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m) e dal hnRNP UL1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus Hnrnpul1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal hnRNP UL1 Plasmide HDR (m) e il plasmide HDR hnRNP UL1 (m2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia Hnrnpul1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio Hnrnpul1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.