Histone Deacetylase 2 (HDAC2) Plasmide KO CRISPR/Cas9 (r): sc-437286

Panoramica

L’istone deacetilasi 2 (HDAC2) è una deacetilasi degli istoni di classe I dipendente da Zn²⁺ che rimuove gruppi acetile dai residui di lisina sugli istoni e su altre proteine nucleari, favorendo la compattazione della cromatina e la repressione della trascrizione. Nelle cellule di ratto, HDAC2 agisce all’interno di complessi corepressori come Sin3, NuRD e CoREST per coordinare programmi di espressione genica che controllano la progressione del ciclo cellulare, la differenziazione, la plasticità sinaptica e le risposte al danno del DNA. Attraverso il crosstalk con reti di segnalazione che includono MAPK/ERK, PI3K-AKT e checkpoint dipendenti da p53, HDAC2 contribuisce a una regolazione della proliferazione e dell’adattamento allo stress specifica del contesto. Un’attività di HDAC2 deregolata è stata associata ad alterazioni dell’espressione genica infiammatoria e a rimodellamenti epigenetici rilevanti per la neurobiologia e la trasformazione oncogenica, rendendola un bersaglio frequente negli studi meccanicistici sui fenotipi guidati dalla cromatina.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO Histone Deacetylase 2 (HDAC2) (r) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene in linee cellulari rat. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina Histone Deacetylase 2 (HDAC2).

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di per lo studio della segnalazione di Histone Deacetylase 2 (HDAC2), studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni critici per la funzione di Histone Deacetylase 2 (HDAC2)
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal Histone Deacetylase 2 (HDAC2) CRISPR/Cas9 KO Plasmid (r) e dal Histone Deacetylase 2 (HDAC2) CRISPR/Cas9 KO Plasmid (r2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus . Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal Histone Deacetylase 2 (HDAC2) Plasmide HDR (r) e il plasmide HDR Histone Deacetylase 2 (HDAC2) (r2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.