Gli oligonucleotidi HIF-1α Gel Shift sono brevi sequenze di DNA meticolosamente sintetizzate per l'uso in saggi Gel Shift, una tecnica cruciale nella ricerca in biologia molecolare volta a chiarire le interazioni proteina-DNA. Il termine "HIF-1α" si riferisce all'hypoxia-inducible factor 1-alpha, un fattore di trascrizione chiave coinvolto nelle risposte cellulari all'ipossia o a bassi livelli di ossigeno. HIF-1α è una subunità del complesso di fattori di trascrizione eterodimerici HIF-1, che regola l'espressione di geni coinvolti nell'adattamento alle condizioni di ipossia, tra cui l'angiogenesi, l'eritropoiesi, il metabolismo del glucosio e la sopravvivenza cellulare. In condizioni di normossia, l'HIF-1α viene idrossilato dagli enzimi prolil-idrossilasi, portando alla sua degradazione attraverso la via dell'ubiquitina-proteasoma. Tuttavia, in condizioni di ipossia, HIF-1α si stabilizza e trasloca nel nucleo, dove forma un complesso con HIF-1β e altri coattivatori, legandosi a specifiche sequenze di DNA, note come elementi di risposta all'ipossia (HRE), all'interno dei promotori di geni bersaglio, modulandone così l'attività trascrizionale. Utilizzando gli oligonucleotidi HIF-1α Gel Shift nei saggi Gel Shift, i ricercatori possono studiare la cinetica di legame, la specificità e l'affinità di HIF-1α alle sue sequenze di DNA bersaglio in varie condizioni sperimentali. Questa tecnica facilita l'elucidazione dei meccanismi molecolari alla base della regolazione genica mediata da HIF-1α e fornisce approfondimenti sulle complesse reti di segnalazione che regolano le risposte cellulari all'ipossia.
Riferimenti:
- L'ipossia induce un percorso di sopravvivenza autocrino-paracrino attraverso il recettore del fattore di crescita di derivazione piastrinica (PDGF)-B/PDGF-beta e la segnalazione della fosfatidilinositolo 3-chinasi/Akt nelle cellule neuronali RN46A. | Zhang, SX., et al. 2003. FASEB J. 17: 1709-11. PMID: 12958184
- Effetti della diminuzione della stimolazione del fattore di crescita insulino-simile-1 sulla sintesi proteica e sulla funzione del fattore inducibile 1-alfa durante la riparazione cutanea nei topi diabetici. | Yu, DH., et al. 2007. Wound Repair Regen. 15: 628-35. PMID: 17971008
- Effetti antinfiammatori del fattore derivato dall'epitelio pigmentato nella nefropatia diabetica. | Wang, JJ., et al. 2008. Am J Physiol Renal Physiol. 294: F1166-73. PMID: 18322021
- Il fattore di crescita della placenta aumenta l'espressione dei recettori dell'endotelina-1 e dell'endotelina-B attraverso il fattore-1 alfa inducibile dall'ipossia. | Patel, N., et al. 2008. Blood. 112: 856-65. PMID: 18411415
- L'acido ferulico aumenta l'angiogenesi attraverso VEGF, PDGF e HIF-1 alfa. | Lin, CM., et al. 2010. J Nutr Biochem. 21: 627-33. PMID: 19443196
- La leucemia a cellule mieloidi-1 (Mc1-1) è un gene candidato a bersaglio dell'hypoxia-inducible factor-1 (HIF-1) nel testicolo. | Palladino, MA., et al. 2012. Reprod Biol Endocrinol. 10: 104. PMID: 23216940
- I prodotti finali glicati avanzati influenzano l'attività trascrizionale di HIF nelle cellule renali. | Bondeva, T., et al. 2013. Mol Endocrinol. 27: 1918-33. PMID: 24030251
- La simvastatina e gli inibitori a valle aggirano la resistenza costitutiva e indotta dalle cellule stromali alla doxorubicina nelle cellule di LLC non mutate IGHV. | Rigoni, M., et al. 2015. Oncotarget. 6: 29833-46. PMID: 26284584
- L'epatite alcolica accelera il cancro epatobiliare precoce aumentando la staminalità e l'attivazione di HIF-1α mediata da miR-122. | Ambade, A., et al. 2016. Sci Rep. 6: 21340. PMID: 26888602
- Il carcinoma epatocellulare è accelerato dalla NASH con la polarizzazione dei macrofagi M2 mediata dall'IL-10 indotta da hif-1α. | Ambade, A., et al. 2016. Oncoimmunology. 5: e1221557. PMID: 27853646
- Il microRNA 122, regolato da GRLH2, protegge il fegato di topi e pazienti dalla malattia epatica indotta dall'etanolo. | Satishchandran, A., et al. 2018. Gastroenterology. 154: 238-252.e7. PMID: 28987423
- L'Hypoxia-Inducible Factor-1α specifico dei macrofagi contribuisce all'alterazione del flusso autofagico nella steatoepatite non alcolica. | Wang, X., et al. 2019. Hepatology. 69: 545-563. PMID: 30102772
- La baicaleina resensibilizza le cellule di cancro al seno resistenti al tamoxifene riducendo la glicolisi aerobica e invertendo la disfunzione mitocondriale attraverso l'inibizione dell'hypoxia-inducible factor-1α. | Chen, Y., et al. 2021. Clin Transl Med. 11: e577. PMID: 34841716