Non dati CRISPR: l'immagine illustra la qualità degli anticorpi per la visualizzazione dei risultati degli esperimenti CRISPR.
Non dati CRISPR: l'immagine illustra la qualità degli anticorpi per la visualizzazione dei risultati degli esperimenti CRISPR.
ephrin-B1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-400873
- Specie Target: human
- 20 µg di DNA plasmidico purificato, pronto per trasfezione; sufficiente fino a 20 trasfezioni
- ephrin-B1 Il plasmide CRISPR/Cas9 Knockout (KO) (h) è un pool di plasmidi, ciascuno dei quali codifica la nucleasi Cas9 e un RNA guida (gRNA) specifico per il bersaglio di 20 nt, progettato per la massima efficienza di knockout utilizzando sequenze derivate dalla libreria GeCKO v2
- Le sequenze gRNA indirizzano Cas9 a indurre rotture a doppio filamento (DSB) sito-specifiche nel locus genomico ephrin-B1, con conseguente knockout genico tramite giunzione non omologa (NHEJ)
- I geni di resistenza alla puromicina e RFP sono fiancheggiati da siti LoxP, consentendo la rimozione dei marcatori di selezione tramite la ricombinasi Cre (Cre Vector: sc-418923) dopo aver stabilito linee cellulari knockout stabili
- In seguito alla trasfezione, l'efficienza dll'attivazione genica può essere testata con WB, IF o IHC utilizzando l'anticorpo: ephrin-B1 Antibody (C-6): sc-515264
Informazioni ordini
| Nome del prodotto | Codice del prodotto | UNITÀ | Prezzo | Quantità | Preferiti | |
ephrin-B1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h) | sc-400873 | 20 µg | $397.00 |
Panoramica
EFNB1 codifica l’efrina-B1, un ligando ancorato alla membrana per le tirosin-chinasi recettoriali Eph che media una segnalazione dipendente dal contatto, controllando il posizionamento cellulare, la formazione di confini e la morfogenesi tissutale. L’efrina-B1 partecipa alla segnalazione bidirezionale Eph/efrina, integrandosi con la regolazione delle GTPasi della famiglia Rho, il rimodellamento del citoscheletro di actina e la dinamica delle giunzioni aderenti per influenzare migrazione e adesione. Attraverso questi processi contribuisce all’angiogenesi, alla guida assonale e all’organizzazione epiteliale, e la sua deregolazione è stata associata ad anomalie dello sviluppo e ad alterazioni della comunicazione cellula-cellula in vie correlate al cancro. EFNB1 è inoltre rilevante negli studi sul dosaggio genico legato al cromosoma X e sul mosaicismo, offrendo un modello per comprendere come le interfacce di segnalazione locale plasmino il patterning dei tessuti.
Il plasmide CRISPR/Cas9 KO ephrin-B1 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene EFNB1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del EFNB1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.
Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto EFNB1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina ephrin-B1.
Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di EFNB1 per lo studio della segnalazione di ephrin-B1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.
Caratteristiche principali
- sgRNA mirati agli esoni EFNB1 critici per la funzione di ephrin-B1
Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di EFNB1 per migliorare l'efficienza del knockout
Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione
Varianti di progettazione
CRISPR +/- HDR
- Gli gRNA codificati dal ephrin-B1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal ephrin-B1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus EFNB1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
I costrutti donatori HDR codificati dal ephrin-B1 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR ephrin-B1 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia EFNB1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio EFNB1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.