DDX21 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (bovine): sc-437356

Panoramica

DDX21 codifica una RNA elicasi nucleolare della famiglia DEAD-box che coordina molteplici fasi della biogenesi dei ribosomi, inclusi la trascrizione e il processamento del pre-rRNA, e sostiene la funzione nucleolare dipendente dalla RNA polimerasi I. Attraverso la sua attività di rimodellamento dell’RNA, DDX21 contribuisce a integrare la maturazione dell’rRNA con programmi più ampi del metabolismo dell’RNA che influenzano la progressione del ciclo cellulare, la proteostasi e le risposte allo stress cellulare. La perturbazione della funzione di DDX21 è associata ad alterazioni dell’integrità del nucleolo e della capacità di traduzione, processi spesso studiati in contesti quali la segnalazione proliferativa, la stabilità del genoma e i fenotipi di adattamento allo stress. Nei sistemi bovini, DDX21 è rilevante per indagini meccanicistiche su crescita e sviluppo, interazioni ospite–patogeno che influenzano la produzione ribosomiale e la regolazione dell’espressione genica legata al nucleolo.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO DDX21 (bovine) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene in linee cellulari bovine. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina DDX21.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di per lo studio della segnalazione di DDX21, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni critici per la funzione di DDX21
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal DDX21 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (bovine) e dal DDX21 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (bovine2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus . Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal DDX21 Plasmide HDR (bovine) e il plasmide HDR DDX21 (bovine2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.