CXCL16 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-425819

概要

Cxcl16はCXCL16をコードしており、CXCL16は膜貫通型ケモカインで、プロテアーゼによって切断（シェディング）されることで可溶性となり、CXCR6のリガンドとして機能します。これにより、活性化T細胞、NKT細胞、その他の白血球サブセットの走化性による動員と組織内での滞留が協調的に制御されます。CXCL16は、血管系および実質組織の微小環境における免疫監視、白血球接着、ならびにサイトカイン駆動性の細胞間クロストークを形作る炎症性シグナルネットワークに関与します。マウスモデルでは、CXCL16/CXCR6シグナルが、動脈硬化性炎症、肝臓や肺での免疫細胞トラフィッキング、腫瘍—免疫相互作用などの過程と関連づけられており、慢性炎症や免疫介在性病態の研究において重要です。その制御は、NF-κB関連の炎症プログラムや、膜結合型と可溶性ケモカイン活性のバランスを調整するエクトドメイン・シェディング経路とも交差します。

CXCL16 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるCxcl16遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Cxcl16内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Cxcl16のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、CXCL16タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、CXCL16シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Cxcl16欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• CXCL16の機能に不可欠なCxcl16エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Cxcl16ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• CXCL16 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびCXCL16 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Cxcl16遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  CXCL16 HDRプラスミド（m）および CXCL16 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはCxcl16ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のCxcl16標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。