CTCF Gel Shift Oligonucleotides: sc-2613

Gli oligonucleotidi CTCF Gel Shift sono brevi sequenze di DNA sintetizzate in modo complesso per l'applicazione nei saggi Gel Shift, una tecnica fondamentale nella ricerca in biologia molecolare volta a esaminare le interazioni tra proteine e DNA. L'acronimo "CTCF" sta per CCCTC-binding factor, un fattore di trascrizione altamente conservato coinvolto in diversi processi cellulari, tra cui la regolazione trascrizionale, l'organizzazione della cromatina e l'imprinting genomico. CTCF si lega a specifiche sequenze di DNA, note come siti di legame di CTCF o sequenze isolanti, all'interno del genoma, dove agisce come regolatore versatile dell'espressione genica modulando la struttura della cromatina e facilitando le interazioni a lungo raggio tra regioni genomiche distanti. Utilizzando gli oligonucleotidi CTCF Gel Shift nei saggi di gel shift, i ricercatori possono esplorare la cinetica di legame, la specificità e l'affinità di CTCF alle sue sequenze di DNA bersaglio in varie condizioni sperimentali. Questa tecnica consente di chiarire i meccanismi molecolari alla base della regolazione genica mediata da CTCF e di comprendere la complessa organizzazione architettonica del genoma.

Riferimenti:

1. Il silenziamento epigenetico nell'atassia di Friedreich è associato alla deplezione di CTCF (CCCTC-binding factor) e alla trascrizione antisenso.  |  De Biase, I., et al. 2009. PLoS One. 4: e7914. PMID: 19956589
2. Identificazione e caratterizzazione funzionale degli elementi cis-regolatori che controllano l'espressione del gene ADRB2 del suino.  |  Jaeger, A., et al. 2015. Int J Biol Sci. 11: 1006-15. PMID: 26221068