Not CRISPR data: the image illustrates antibody quality for visualizing CRISPR experiment results.
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CDK5RAP1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-407278
- Specie Target: human
- 20 µg di DNA plasmidico purificato, pronto per trasfezione; sufficiente fino a 20 trasfezioni
- CDK5RAP1 Il plasmide CRISPR/Cas9 Knockout (KO) (h) è un pool di plasmidi, ciascuno dei quali codifica la nucleasi Cas9 e un RNA guida (gRNA) specifico per il bersaglio di 20 nt, progettato per la massima efficienza di knockout utilizzando sequenze derivate dalla libreria GeCKO v2
- Le sequenze gRNA indirizzano Cas9 a indurre rotture a doppio filamento (DSB) sito-specifiche nel locus genomico CDK5RAP1, con conseguente knockout genico tramite giunzione non omologa (NHEJ)
- I geni di resistenza alla puromicina e RFP sono fiancheggiati da siti LoxP, consentendo la rimozione dei marcatori di selezione tramite la ricombinasi Cre (Cre Vector: sc-418923) dopo aver stabilito linee cellulari knockout stabili
- In seguito alla trasfezione, l'efficienza dll'attivazione genica può essere testata con WB, IF o IHC utilizzando l'anticorpo: CDK5RAP1 Antibody (D-1): sc-398764
Informazioni ordini
| Nome del prodotto | Codice del prodotto | UNITÀ | Prezzo | Quantità | Preferiti | |
CDK5RAP1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h) | sc-407278 | 20 µg | $397.00 |
Panoramica
CDK5RAP1 (proteina 1 associata alla subunità regolatoria CDK5) è un enzima radicale S-adenosilmetionina localizzato principalmente nei mitocondri, dove catalizza la modificazione post-trascrizionale dei tRNA mitocondriali, supportando un’accurata traduzione mitocondriale e l’integrità della catena respiratoria. Regolando la proteostasi mitocondriale e la capacità di fosforilazione ossidativa, CDK5RAP1 influenza il metabolismo energetico cellulare, l’equilibrio redox e le risposte adattative allo stress. Un’alterata attività di CDK5RAP1 è stata associata a una funzione mitocondriale compromessa ed è spesso studiata in contesti di rimodellamento metabolico, adattamento all’ipossia e stabilità del genoma in condizioni di stress ossidativo. Questi percorsi rendono CDK5RAP1 un bersaglio rilevante per studi meccanicistici in biologia del cancro e in altri disturbi caratterizzati da disfunzione mitocondriale.
Il plasmide CRISPR/Cas9 KO CDK5RAP1 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene CDK5RAP1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del CDK5RAP1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.
Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto CDK5RAP1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina CDK5RAP1.
Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di CDK5RAP1 per lo studio della segnalazione di CDK5RAP1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.
Caratteristiche principali
- sgRNA mirati agli esoni CDK5RAP1 critici per la funzione di CDK5RAP1
Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di CDK5RAP1 per migliorare l'efficienza del knockout
Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione
Varianti di progettazione
CRISPR +/- HDR
- Gli gRNA codificati dal CDK5RAP1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal CDK5RAP1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus CDK5RAP1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
I costrutti donatori HDR codificati dal CDK5RAP1 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR CDK5RAP1 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia CDK5RAP1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio CDK5RAP1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.