CD362/SDC2/Syndecan-2 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (m): sc-420985

Panoramica

Sdc2 codifica per syndecan-2 (CD362/SDC2), un proteoglicano transmembrana a eparan solfato che funge da co-recettore per componenti della matrice extracellulare e per fattori di crescita leganti l’eparina. Organizzando le interazioni tra proteoglicani di superficie e ligandi, SDC2 regola l’adesione cellulare, la migrazione e il rimodellamento del citoscheletro, e influenza la segnalazione attraverso vie quali FGF, VEGF, Wnt e le reti integrina/FAK–SRC. Nei sistemi murini, Sdc2 è stato utilizzato per studiare la comunicazione stroma–epitelio, le risposte angiogeniche e il rimodellamento tissutale in modelli di sviluppo e di danno. Alterazioni dell’espressione o della glicosilazione di SDC2 sono inoltre studiate in contesti di fibrosi e di biologia del microambiente tumorale, dove la segnalazione dipendente dalla matrice può modulare proliferazione e invasività.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO CD362/SDC2/Syndecan-2 (m) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene Sdc2 in linee cellulari mouse. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del Sdc2 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto Sdc2 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina CD362/SDC2/Syndecan-2.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di Sdc2 per lo studio della segnalazione di CD362/SDC2/Syndecan-2, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni Sdc2 critici per la funzione di CD362/SDC2/Syndecan-2
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di Sdc2 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal CD362/SDC2/Syndecan-2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m) e dal CD362/SDC2/Syndecan-2 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus Sdc2. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal CD362/SDC2/Syndecan-2 Plasmide HDR (m) e il plasmide HDR CD362/SDC2/Syndecan-2 (m2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia Sdc2 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio Sdc2 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.