C530008M17Rik Plasmide KO CRISPR/Cas9 (m): sc-435830

Panoramica

C530008M17Rik codifica una proteina murina che rimane caratterizzata solo in modo incompleto, con una disponibilità limitata di annotazioni funzionali nelle attuali risorse genomiche. In quanto prodotto genico previsto, viene spesso studiata nel contesto di dataset trascrittomici e proteomici per definire pattern di espressione specifici per tipo cellulare e potenziali ruoli subcellulari. Evidenze emergenti da analisi di co-espressione e da screening di perturbazione genetica possono contribuire a collocare C530008M17Rik all’interno di processi cellulari più ampi, come la differenziazione, le risposte allo stress o l’omeostasi specifica di tessuto, a seconda del sistema sperimentale. Data la scarsità di dati meccanicistici, approcci di knockout mirati sono comunemente utilizzati per chiarire il coinvolgimento in specifiche vie di segnalazione e i potenziali legami con fenotipi rilevanti per la biologia dello sviluppo e per la modellistica delle malattie.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO C530008M17Rik (m) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene C530008M17Rik in linee cellulari mouse. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del C530008M17Rik insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto C530008M17Rik a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina C530008M17Rik.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di C530008M17Rik per lo studio della segnalazione di C530008M17Rik, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni C530008M17Rik critici per la funzione di C530008M17Rik
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di C530008M17Rik per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal C530008M17Rik CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m) e dal C530008M17Rik CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus C530008M17Rik. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal C530008M17Rik Plasmide HDR (m) e il plasmide HDR C530008M17Rik (m2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia C530008M17Rik per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio C530008M17Rik definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.