Acridine Orange 10-nonyl bromide (CAS 75168-11-5)

L'arancio di acridina 10-nonil bromuro, un derivato del colorante basico arancio di acridina, è un composto cationico fluorescente ampiamente utilizzato nella ricerca scientifica, in particolare nello studio delle strutture cellulari e molecolari. La struttura chimica di questo composto aumenta la sua capacità di intercalarsi negli acidi nucleici, rendendolo uno strumento prezioso per la colorazione del DNA e dell'RNA in cellule e campioni di tessuto. Il meccanismo d'azione dell'arancio di acridina 10-nonil bromuro prevede il suo inserimento tra le coppie di basi impilate dell'elica del DNA o dell'RNA, dove diventa fluorescente, consentendo ai ricercatori di visualizzare i componenti degli acidi nucleici all'interno delle cellule con la microscopia a fluorescenza. Questa colorazione non è semplicemente differenziale, ma anche metacromatica, il che significa che il colorante emette colori diversi a seconda del tipo di acido nucleico a cui si lega: tipicamente emette fluorescenza verde quando è legato al DNA e rossa quando è associato all'RNA. Questa proprietà è particolarmente utile negli studi sull'apoptosi, dove è possibile osservare i cambiamenti nella cromatina nucleare in funzione del processo apoptotico. Inoltre, è stato utilizzato in citogenetica per differenziare i cromosomi e rilevare le aberrazioni cromosomiche. In microbiologia ambientale, l'arancio di acridina 10-nonil bromuro facilita la rapida individuazione delle cellule batteriche nei campioni ambientali, migliorando la visualizzazione al microscopio a fluorescenza. La capacità del colorante di emettere fluorescenza a diverse lunghezze d'onda in base all'ambiente molecolare lo rende inoltre uno strumento eccellente per lo studio delle dinamiche del ciclo cellulare e della compartimentazione cellulare degli acidi nucleici, contribuendo alla sua ampia applicazione nella ricerca in biologia cellulare.