Gli inibitori di SPANX-E comprendono una vasta gamma di entità chimiche che si impegnano in varie vie cellulari per diminuire l'attività funzionale della proteina. La modulazione dell'attività delle chinasi è uno di questi meccanismi, dove l'inibizione delle chinasi che sono regolatori a monte può portare alla soppressione dell'attività di SPANX-E. Ciò avviene attraverso l'interruzione di cascate di segnalazione, come la via MAPK/ERK, che, se inibita, può determinare una riduzione della funzionalità di SPANX-E. La via della fosfatidilinositolo 3-chinasi (PI3K) è un'altra via critica di trasduzione del segnale che, in caso di interferenza, può influenzare indirettamente SPANX-E. Gli inibitori che hanno come bersaglio PI3K o mTOR, un bersaglio a valle di PI3K, possono alterare l'attività di SPANX-E impedendo la capacità della via di segnalare il suo impegno funzionale.
Inoltre, la funzione di SPANX-E può essere attenuata da modulatori che influenzano i meccanismi di regolazione dell'espressione genica. I composti che inibiscono le istone deacetilasi possono alterare l'accessibilità alla cromatina e potenzialmente ridurre l'espressione di SPANX-E. Inoltre, le vie che regolano la risposta della cellula allo stress, comprese quelle mediate da p53, possono essere sfruttate da inibitori che stabilizzano p53, potenzialmente riducendo così SPANX-E. L'integrità dei componenti citoscheletrici della cellula, che potrebbe essere collegata al ruolo di SPANX-E, è un'altra strada per l'inibizione funzionale. L'interruzione della dinamica dei microtubuli, ad esempio, può ostacolare SPANX-E se è associata a processi come la motilità o la divisione cellulare.
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