Ribosomal Protein S11 Inibitori

I comuni inibitori della proteina ribosomiale S11 includono, a titolo esemplificativo, il cloramfenicolo CAS 56-75-7, l'α-Sarcin CAS 86243-64-3, la cicloeximide CAS 66-81-9, l'anisomicina CAS 22862-76-6 e la puromicina CAS 53-79-2.

Gli inibitori chimici della proteina ribosomiale S11 possono esercitare i loro effetti inibitori attraverso varie interazioni con il macchinario ribosomiale, che è centrale nella sintesi proteica. Il cloramfenicolo, ad esempio, si lega alle subunità ribosomiali e inibisce la sintesi proteica batterica. A causa delle somiglianze strutturali tra la proteina ribosomiale S11 eucariotica e le proteine ribosomiali batteriche, il cloramfenicolo può inibire la sua funzione. Allo stesso modo, la ricina, un potente inibitore, depurina l'adenina dall'rRNA all'interno della subunità ribosomiale, portando a un'interruzione della funzione essenziale del ribosoma, inibendo così indirettamente la proteina ribosomiale S11. L'alfa-sarcina ottiene l'inibizione scindendo un legame fosfodiestere nell'rRNA, interrompendo la funzione del ribosoma e di conseguenza inibendo il ruolo della proteina ribosomiale S11 nel complesso.

La cicloeximide e l'anisomicina hanno come bersaglio il ribosoma eucariotico, dove la cicloeximide interferisce con la fase di traslocazione e l'anisomicina si lega alla subunità 60S, inibendo l'attività della peptidil transferasi. Entrambe le azioni determinano un'inibizione indiretta della proteina ribosomiale S11, interrompendo il suo ruolo nella traduzione dell'mRNA e nell'allungamento del peptide, rispettivamente. La puromicina e l'emetina, invece, inibiscono la sintesi proteica agendo sul processo di allungamento della catena peptidica, dove la puromicina causa la terminazione prematura della catena e l'emetina si lega alla subunità 40S, ostacolando il coinvolgimento della proteina ribosomiale S11 nell'allungamento della traduzione. La pactamicina, legandosi alla subunità 30S, blocca l'iniziazione della traduzione, mentre l'arringtonina e l'omoarringtonina impediscono la fase di allungamento della traduzione, tutti fattori che limitano la capacità funzionale della proteina ribosomiale S11. Anche la blasticidina S e la sparsomicina agiscono sul processo di formazione del legame peptidico agendo sulla componente peptidil-trasferasi del ribosoma, inibendo indirettamente il ruolo della proteina ribosomiale S11 nella sintesi delle proteine.