Gli attivatori di PP6R3 sono un insieme eterogeneo di composti chimici che potenziano indirettamente l'attività funzionale della fosfatasi proteica PP6R3. L'acido okadaico, la calicolina A, la fostriecina, la cantaridina, la microcistina-LR, l'endotall e la tautomicina fungono da inibitori delle fosfatasi proteiche come PP1 e PP2A; la loro azione può portare a un aumento compensativo dell'attività di PP6R3, in quanto la cellula tenta di mantenere un equilibrio nelle attività delle fosfatasi. Questa modalità indiretta di attivazione pone PP6R3 in una posizione di maggiore influenza relativa sui processi di de-fosforilazione all'interno della cellula. Analogamente, la ionomicina, aumentando i livelli di calcio intracellulare, potrebbe rafforzare l'attività di PP6R3 indirettamente, attraverso l'attivazione di fosfatasi proteiche calcio-dipendenti che lavorano di concerto con PP6R3 per regolare le reti di difosforilazione cellulare.
L'attività di PP6R3 è ulteriormente influenzata dalla forskolina che, aumentando i livelli di cAMP, promuove indirettamente il ruolo di PP6R3 nel contrastare la fosforilazione attraverso la segnalazione PKA cAMP-dipendente. L'acido zoledronico, attraverso la sua interferenza con gli enzimi basati sui fosfati.
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