PDF Attivatori

I comuni attivatori di PDF includono, ma non solo, lo zinco CAS 7440-66-6, il D(+)glucosio anidro CAS 50-99-7, la N-acetil-D-glucosamina CAS 7512-17-6, il lipopolisaccaride, E. coli O55:B5 CAS 93572-42-0 e l'acido folico CAS 59-30-3.

Alcune sostanze chimiche possono influenzare indirettamente l'attività o l'espressione della PDF modulando processi e vie cellulari all'interno dei batteri. Questi attivatori indiretti non si legano alla PDF né alterano direttamente il suo meccanismo enzimatico. Invece, influenzano l'ambiente cellulare o le vie metaboliche che, a loro volta, possono avere un impatto a valle sulla funzione della PDF.

Queste influenze indirette includono ioni essenziali come il magnesio e lo zinco, che possono stabilizzare le strutture enzimatiche, e substrati metabolici chiave come il glucosio, gli aminoacidi e il NADH, che sono parte integrante del metabolismo batterico e della sintesi proteica. La disponibilità di questi substrati e cofattori può modulare indirettamente l'attività di enzimi come la PDF. Altri componenti come i cluster ferro-zolfo, la N-acetilglucosamina e il peptidoglicano sono fondamentali per la crescita e l'integrità strutturale dei batteri e la loro abbondanza o scarsità può influenzare lo stato metabolico generale dei batteri, influenzando l'espressione o l'attività della PDF.