L'ortovanadato di sodio svolge un ruolo cruciale nel sostenere la fosforilazione delle proteine inibendo le fosfatasi, che normalmente invertono questa modificazione. Il rimodellamento della cromatina è un'altra via di regolazione dell'attività proteica. La 5-azacitidina e la tricostatina A, inibendo rispettivamente le metiltransferasi del DNA e le istone deacetilasi, favoriscono uno stato di cromatina più aperta, che porta all'attivazione trascrizionale dei geni. L'analogo del cAMP, il dibutirril-cAMP, bypassa i recettori cellulari e stimola direttamente la proteina chinasi A, determinando la fosforilazione e l'attivazione di proteine all'interno di varie cascate di segnalazione.
La proteostasi è mantenuta da composti come MG132, che inibisce il proteasoma, impedendo così la degradazione delle proteine e aumentandone potenzialmente la concentrazione cellulare. Analogamente, il 17-AAG interrompe la funzione di Hsp90, uno chaperone coinvolto nel ripiegamento e nella stabilizzazione delle proteine, che può portare all'attivazione delle sue proteine clienti. Le vie di trasduzione del segnale sono intricate da molecole come LY294002 e U0126, che sono inibitori rispettivamente di PI3K e MEK. Questi inibitori possono portare all'attivazione di proteine a valle delle vie di segnalazione. SB203580 inibisce specificamente la p38 MAPK, che è coinvolta nella risposta agli stimoli di stress e può influenzare lo stato di attivazione delle proteine regolate da questa via. La segnalazione del calcio è un'altra via critica influenzata dagli attivatori chimici. La tapsigargina interrompe i depositi di calcio inibendo la pompa SERCA, determinando un aumento del calcio citosolico che può attivare una serie di proteine calcio-dipendenti. La tunicamicina, un inibitore della glicosilazione N-linked, svolge un ruolo nel ripiegamento e nella stabilità delle proteine, che può avere effetti profondi sullo stato di attivazione delle proteine.
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