Wortmannin e Alsterpaullone, inibendo rispettivamente le chinasi PI3K e le chinasi ciclina-dipendenti, introducono alterazioni nelle cascate di segnalazione e nella progressione del ciclo cellulare. U0126 e SP600125 offrono un blocco mirato di MEK e JNK, modulando la via MAPK/ERK e le vie di risposta allo stress, con ramificazioni per le proteine che fanno parte di queste reti di segnalazione.
Le proteine che interagiscono o sono regolate dalla protein chinasi C e da Hsp90 possono essere influenzate da Gö6976 e Geldanamicina, che destabilizzano le cascate di segnalazione e le vie di ripiegamento delle proteine. PD173074 e BML-275 offrono un approccio più mirato, mirando alle vie FGFR e AMPK e, per estensione, influenzando le proteine che trasmettono questi segnali di crescita e metabolici. SB431542 e Y-27632 hanno un ruolo nella modulazione dell'attività del recettore TGF-β e delle dinamiche citoscheletriche ROCK-dipendenti, con un potenziale impatto sulle proteine legate a questi processi. Infine, MG-132 e Rapamicina, inibendo rispettivamente l'attività del proteasoma e di mTOR, possono portare a un accumulo di proteine all'interno delle cellule e a una riduzione della sintesi proteica, influenzando così la stabilità e la produzione di un ampio spettro di proteine, comprese quelle indirettamente associate a LOC400553.
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