Gli inibitori di FAM71E2 comprendono una serie di composti che influenzano indirettamente l'attività della proteina, colpendo il citoscheletro di actina e le vie di segnalazione correlate. Wiskostatin e CK-0944666 manipolano la dinamica dell'actina inibendo N-WASP e stabilizzando i filamenti di actina, rispettivamente. Queste azioni determinano una modifica del citoscheletro di actina, essenziale per le funzioni associate a FAM71E2. ML141 e IPA-3 hanno come bersaglio le GTPasi direttamente coinvolte nella polimerizzazione e nel rimodellamento dell'actina. Inibendo Cdc42 e Pak1, questi composti possono portare a una riduzione della dinamica dell'actina, che potrebbe, a sua volta, inibire la funzione di FAM71E2, se questa dipende dall'integrità e dalla dinamica del citoscheletro di actina.
Inoltre, composti come la chelerythrina e l'NSC23766 interferiscono con le vie di segnalazione della protein chinasi C e di Rac1, entrambe fondamentali per il mantenimento della struttura e della dinamica dell'actina. L'inibizione di queste chinasi può portare a un'alterazione dell'organizzazione dell'actina, che potrebbe potenzialmente inibire la funzione di FAM71E2 associata ai processi basati sull'actina. Analogamente, SMIFH2, Y-27632 e Dimetilfasudil mirano alla regolazione della nucleazione dell'actina e del macchinario contrattile, inibendo rispettivamente i processi mediati dalla formina e la via della proteina chinasi associata a Rho (ROCK). Questi inibitori possono interrompere la formazione e la stabilizzazione dei filamenti di actina, che sono fondamentali per le funzioni in cui è coinvolto FAM71E2. ZCL278 e EHop-016 inibiscono specificamente la segnalazione di Cdc42 e Rac1, a ulteriore sostegno dell'idea che la modulazione delle vie delle piccole GTPasi possa avere un impatto significativo sull'attività funzionale di FAM71E2 alterando il citoscheletro di actina.