Gli attivatori della DNPEP comprendono una vasta gamma di sostanze chimiche che possono interagire con l'aspartil aminopeptidasi, determinandone il potenziamento della funzione. La forskolina, un composto che aumenta i livelli del messaggero intracellulare cAMP, e il PMA, che attiva la proteina chinasi C, fungono da modulatori indiretti della DNPEP. La loro influenza sulle vie di segnalazione potrebbe avere effetti a valle che convergono sull'attività di DNPEP.
Neurotrasmettitori come l'epinefrina, la noradrenalina, la dopamina e la serotonina possono modulare indirettamente la funzione della DNPEP avviando cascate di segnalazione al momento del legame con i rispettivi recettori. Gli ionofori di calcio, alterando la concentrazione intracellulare di calcio, possono avere un ruolo nella modulazione enzimatica, dato che molti enzimi sono calcio-dipendenti. Analogamente, l'ATP, in quanto molecola energetica, è fondamentale in vari processi cellulari, compresa l'attività enzimatica. Il glutammato e il GABA, in quanto principali eccitatori e neurotrasmettitori, rispettivamente, nel sistema nervoso centrale, potrebbero essere coinvolti in percorsi che si intersecano con il ruolo del DNPEP.
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