Gli inibitori della CCDC124 sono un gruppo eterogeneo di composti chimici che influenzano indirettamente l'attività della proteina CCDC124 prendendo di mira varie vie di segnalazione e processi cellulari. La staurosporina, ad esempio, è un inibitore di chinasi ad ampio spettro che, riducendo la fosforilazione di un'ampia gamma di proteine, può portare indirettamente a una diminuzione dell'attività del CCDC124, supponendo che l'attività del CCDC124 dipenda da tali eventi di fosforilazione. L'alsterpaullone, che ha come bersaglio le chinasi ciclina-dipendenti, arresterebbe il ciclo cellulare e i meccanismi trascrizionali, riducendo potenzialmente l'attività delle proteine che regolano o sono necessarie per la funzione del CCDC124. Questo meccanismo presuppone che l'attività del CCDC124 sia strettamente legata alle proteine modulate dalle CDK durante la progressione del ciclo cellulare.
Altri composti, come la bisindolilmaleimide I e il Gö 6983, inibiscono isoforme specifiche della protein chinasi C, alterando potenzialmente lo stato di fosforilazione delle proteine che modulano l'attività del CCDC124. L'inibizione efficace di proteine chinasi come quelle della famiglia Src da parte di PP2 o di chinasi mirate da parte di Sorafenib può diminuire l'attività delle vie di segnalazione che contribuiscono allo stato funzionale di CCDC124.
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