La forskolina e la ionomicina aumentano i livelli di cAMP e di calcio intracellulare, rispettivamente, che agiscono come messaggeri secondari in varie vie di segnalazione. L'attivazione di queste vie può portare alla fosforilazione delle proteine e all'avvio di una cascata di effetti a valle che possono modulare la funzione delle proteine. Il PMA e composti come la tricostatina A e il butirrato di sodio alterano l'attività di enzimi come la PKC e l'HDAC, rispettivamente, che sono modulatori chiave della fosforilazione delle proteine e dell'espressione genica.
La 5-azacitidina e il cloruro di litio esercitano i loro effetti a livello genetico, influenzando la metilazione del DNA e la segnalazione Wnt. LY294002, Rapamicina e SB431542 hanno come bersaglio specifico molecole di segnalazione chiave come PI3K, mTOR e recettori TGF-β, che sono centrali nella regolazione della sintesi proteica, dell'autofagia e della segnalazione SMAD. PD98059 e DAPT interferiscono rispettivamente con la via MAPK/ERK e con la segnalazione Notch, entrambe fondamentali per la regolazione dell'attività proteica e dei processi di differenziazione cellulare.
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