Gli inibitori chimici di C16orf77 possono modulare la sua funzione attraverso vari meccanismi, ciascuno distinto in base alla via di segnalazione bersaglio della sostanza chimica. La staurosporina e la bisindolilmaleimide I sono esempi di tali inibitori, che agiscono sulle chinasi proteiche da cui C16orf77 dipende per la sua attività. La staurosporina è un inibitore di protein chinasi ad ampio spettro, che esercita il suo effetto inibendo direttamente l'attività della chinasi, essenziale per la funzione di C16orf77. La bisindolilmaleimide I, invece, ha come bersaglio specifico la proteina chinasi C (PKC), che si trova a monte di C16orf77. Inibendo la PKC, la bisindolilmaleimide I porta indirettamente a una diminuzione dell'attività di C16orf77.
Più in profondità nella rete di segnalazione cellulare, LY294002 e Wortmannin esercitano i loro effetti inibendo le fosfoinositide 3-chinasi (PI3K), impedendo così l'attivazione delle vie a valle in cui è coinvolto C16orf77. Bloccando la PI3K, questi inibitori riducono funzionalmente l'attività di C16orf77. Analogamente, la rapamicina agisce sulla via del mammalian target of rapamycin (mTOR), un hub di segnalazione cellulare centrale. L'inibizione di mTOR da parte della rapamicina può ridurre la funzione di C16orf77 se la sua attività è regolata da o a valle della via mTOR. A complemento di questi, U0126 e PD98059 si concentrano sulla via MEK/ERK. Come inibitori di MEK, impediscono l'attivazione di ERK, una proteina chinasi che regola diverse funzioni cellulari. Se C16orf77 opera in questa via, la sua attività verrebbe ridotta da questi inibitori. SB203580 e SP600125 si aggiungono alla schiera mirando rispettivamente alle vie di segnalazione p38 MAPK e JNK.
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