Gli inibitori di BSMAP hanno come bersaglio vari componenti delle vie intracellulari per interferire con i ruoli funzionali della proteina. Alcuni inibitori, come SB203580 e PD98059, hanno come bersaglio la via MAPK, influenzando così i modelli di fosforilazione da cui BSMAP dipende. Altri, come LY294002 e Wortmannin, si concentrano sulla via PI3K/Akt, influenzando le risposte cellulari, come la sopravvivenza e la crescita, a cui BSMAP potrebbe essere associata. Prodotti chimici come l'U0126 hanno una portata più ampia, in quanto agiscono sia su MEK1 che su MEK2, influenzando così una gamma più ampia di vie chinasi-dipendenti a cui BSMAP può partecipare. L'inibizione di queste vie può modificare il contesto cellulare in cui BSMAP funziona, influenzando così indirettamente il suo ruolo.
Vengono prese in considerazione anche le vie Src e JAK/STAT, che possono intersecarsi con altre vie in cui BSMAP è coinvolta e che inibitori come PP2 e AG-490 agiscono per modulare. La segnalazione del calcio è un altro aspetto importante e KN-93 serve a inibire la CaMKII, che può svolgere un ruolo in vari processi cellulari, compresi quelli che coinvolgono BSMAP. Nel complesso, l'obiettivo di questi inibitori è quello di interferire con il ruolo funzionale di BSMAP alterando o inibendo le vie e i processi chiave da cui dipende o con cui interagisce.
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