Gli inibitori dell'ANKRD29 sono sostanze chimiche, alcune delle quali sono note per influenzare indirettamente le proteine con ripetizioni anchiriniche, colpendo alcune vie in cui sono coinvolte. Una di queste vie è la cascata di segnalazione NF-kappaB, un percorso fondamentale nell'infiammazione e nell'immunità cellulare. Data l'ubiquità dei domini di ripetizione dell'anchirina nel percorso NF-kappaB, gli inibitori che hanno come bersaglio questa cascata di segnalazione possono, a loro volta, avere un impatto sulle proteine contenenti ripetizioni dell'anchirina.
La cardamonina, ad esempio, può interrompere la via NF-kappaB, influenzando così potenzialmente la funzione di proteine, come ANKRD29, con ripetizioni di anichina. Gli inibitori di IKK (IκB chinasi), come Ro 106-9920, Wedelolactone e BAY 11-7082, possono modulare la segnalazione di NF-kappaB prendendo di mira le chinasi regolatrici a monte, influenzando indirettamente le proteine contenenti il dominio ankyrin repeat. Un altro angolo di interazione è rappresentato da molecole come JSH-23, che blocca la traslocazione nucleare di NF-kappaB p65, influenzando successivamente le proteine a valle. Il partenolide, invece, interagisce con il complesso della chinasi IκB, svolgendo un ruolo nella modulazione delle proteine contenenti ancherina. Inoltre, inibitori come IMD-0354, ML120B, sc-514, TPCA-1, BMS-345541 e PS-1145 sono noti per avere come bersaglio vari aspetti della via NF-kappaB, che a loro volta possono influenzare lo stato funzionale di proteine, tra cui potenzialmente ANKRD29, con ripetizioni di ankyrin.
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