TRIM34 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-417920

Panoramica

TRIM34 codifica una ligasi E3 dell’ubiquitina contenente un motivo tripartito della famiglia TRIM, implicata nella regolazione dell’immunità innata e nella restrizione antivirale. Attraverso i suoi domini RING, B-box e coiled-coil, TRIM34 può influenzare la segnalazione dipendente dall’ubiquitina e il turnover proteico, modellando vie come le risposte stimolate dagli interferoni e la segnalazione dei recettori di riconoscimento dei pattern. Un’alterata attività della famiglia TRIM è spesso associata a infiammazione disregolata e alle interazioni ospite–patogeno, rendendo TRIM34 rilevante per lo studio dei meccanismi che modulano l’omeostasi immunitaria. TRIM34 è inoltre utilizzato come regolatore candidato nelle analisi a livello di sistema della biologia delle infezioni e dei fenotipi di malattia associati al sistema immunitario.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO TRIM34 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene TRIM34 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del TRIM34 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto TRIM34 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina TRIM34.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di TRIM34 per lo studio della segnalazione di TRIM34, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni TRIM34 critici per la funzione di TRIM34
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di TRIM34 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal TRIM34 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal TRIM34 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus TRIM34. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal TRIM34 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR TRIM34 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia TRIM34 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio TRIM34 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.