Non dati CRISPR: l'immagine illustra la qualità degli anticorpi per la visualizzazione dei risultati degli esperimenti CRISPR.
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TRAP-1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-402963
- Specie Target: human
- 20 µg di DNA plasmidico purificato, pronto per trasfezione; sufficiente fino a 20 trasfezioni
- TRAP-1 Il plasmide CRISPR/Cas9 Knockout (KO) (h) è un pool di plasmidi, ciascuno dei quali codifica la nucleasi Cas9 e un RNA guida (gRNA) specifico per il bersaglio di 20 nt, progettato per la massima efficienza di knockout utilizzando sequenze derivate dalla libreria GeCKO v2
- Le sequenze gRNA indirizzano Cas9 a indurre rotture a doppio filamento (DSB) sito-specifiche nel locus genomico TRAP-1, con conseguente knockout genico tramite giunzione non omologa (NHEJ)
- I geni di resistenza alla puromicina e RFP sono fiancheggiati da siti LoxP, consentendo la rimozione dei marcatori di selezione tramite la ricombinasi Cre (Cre Vector: sc-418923) dopo aver stabilito linee cellulari knockout stabili
- In seguito alla trasfezione, l'efficienza dll'attivazione genica può essere testata con WB, IF o IHC utilizzando l'anticorpo: TRAP-1 Antibody (C-8): sc-13134
Informazioni ordini
| Nome del prodotto | Codice del prodotto | UNITÀ | Prezzo | Quantità | Preferiti | |
TRAP-1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h) | sc-402963 | 20 µg | $397.00 |
Panoramica
TGFBRAP1 codifica la proteina 1 associata al recettore del fattore di crescita trasformante beta (TRAP-1), un adattatore citoplasmatico coinvolto nella modulazione della segnalazione della superfamiglia TGF-β. È stato riportato che TRAP-1 si associa a componenti del complesso recettoriale del TGF-β e influenza le risposte trascrizionali a valle dipendenti da SMAD, che regolano proliferazione, differenziamento, rimodellamento della matrice extracellulare e programmi genici legati all’immunità. Grazie al suo ruolo nel determinare l’output della via e gli eventi prossimali al recettore, TGFBRAP1 viene studiato nel contesto del crosstalk tra vie di segnalazione e delle transizioni di stato cellulare. Una regolazione alterata della via del TGF-β è ampiamente rilevante per la fibrosi, la biologia dei tumori e i meccanismi delle malattie infiammatorie, rendendo TRAP-1 un bersaglio utile per studi meccanicistici sulle vie di segnalazione.
Il plasmide CRISPR/Cas9 KO TRAP-1 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene TGFBRAP1 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del TGFBRAP1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.
Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto TGFBRAP1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina TRAP-1.
Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di TGFBRAP1 per lo studio della segnalazione di TRAP-1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.
Caratteristiche principali
- sgRNA mirati agli esoni TGFBRAP1 critici per la funzione di TRAP-1
Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di TGFBRAP1 per migliorare l'efficienza del knockout
Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione
Varianti di progettazione
CRISPR +/- HDR
- Gli gRNA codificati dal TRAP-1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal TRAP-1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus TGFBRAP1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
I costrutti donatori HDR codificati dal TRAP-1 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR TRAP-1 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia TGFBRAP1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio TGFBRAP1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.