RBM47 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (m): sc-434185

Panoramica

Rbm47 codifica RBM47, una proteina legante l’RNA che si associa ai trascritti per influenzare la regolazione genica post-trascrizionale, inclusi la stabilità dell’mRNA, lo splicing e gli esiti dell’editing dell’RNA. RBM47 è stata collegata alla via di editing dell’RNA citidina‑uridina (C‑to‑U) dipendente da APOBEC1, contribuendo alla diversificazione dei trascritti in contesti epiteliali e gastrointestinali. Attraverso la modulazione dei programmi di processamento dell’RNA, RBM47 può incidere su decisioni di stato cellulare come la differenziazione e l’integrità epiteliale, con collegamenti riportati a firme di espressione genica disregolate in contesti rilevanti per cancro e infiammazione. Nei sistemi murini, la perturbazione di Rbm47 offre un approccio gestibile per analizzare il controllo, centrato sull’RNA, delle reti di segnalazione e dell’omeostasi tissutale.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO RBM47 (m) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene Rbm47 in linee cellulari mouse. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del Rbm47 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto Rbm47 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina RBM47.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di Rbm47 per lo studio della segnalazione di RBM47, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni Rbm47 critici per la funzione di RBM47
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di Rbm47 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal RBM47 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m) e dal RBM47 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus Rbm47. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal RBM47 Plasmide HDR (m) e il plasmide HDR RBM47 (m2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia Rbm47 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio Rbm47 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.