IFRD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド (m): sc-421053

概要

Ifrd1（interferon-related developmental regulator 1：インターフェロン関連発生制御因子1。Tis7/PC4としても知られる）は、細胞の分化・増殖・ストレス応答を制御する遺伝子発現プログラムを調節する転写コリギュレーターをコードします。IFRD1はクロマチン関連複合体と相互作用し、炎症シグナル伝達、筋形成や神経発生の経路、さらに免疫細胞機能に結びつく転写出力に影響を及ぼし得ます。マウスモデルでは、Ifrd1活性の変化が好中球のエフェクター応答や組織修復の表現型の変化と関連づけられており、炎症や変性過程の研究における重要性を示唆しています。IFRD1は状況依存的な転写ネットワークに影響するため、系統決定、再生、宿主応答の生物学的機構の解明で頻繁に研究対象となっています。

IFRD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）は、mouse細胞株におけるIfrd1遺伝子の標的破壊を目的として設計されたプラスミドのプールである。各プラスミドは、Ifrd1内の異なる部位を標的とする固有のシングルガイドRNA（sgRNA）と、Streptococcus pyogenes由来のCas9ヌクレアーゼを共発現します。また、これらのプラスミドはGFPをコードしており、蛍光顕微鏡やフローサイトメトリーを用いて、トランスフェクションに成功した細胞を蛍光で識別・濃縮することが可能です。

このマルチガイド設計により、Cas9による二本鎖切断の形成後に、Ifrd1のオープンリーディングフレームを破壊する挿入または欠失（インデル）が生じる可能性が高まります。CRISPR/Cas9システムによって導入されたDNA切断は、内因性の非相同末端結合（NHEJ）経路を通じて修復され、その結果、IFRD1タンパク質の発現を阻害するフレームシフト変異が生じることが頻繁にあります。

このCRISPRノックアウトシステムにより、IFRD1シグナル伝達、機能ゲノミクス研究、がん生物学研究、およびヒト細胞株における治療反応の評価を目的とした、Ifrd1欠損細胞モデルの効率的な作製が可能となる。

主な特徴

• IFRD1の機能に不可欠なIfrd1エクソンを標的とするsgRNA
  導入を簡素化するための、単一プラスミドからのSpCas9およびsgRNAの共発現
  トランスフェクトされた細胞を識別するためのGFPレポーター
  ノックアウト効率を向上させるための、Ifrd1ゲノム上の複数の部位を標的とするプラスミドのプール
  トランスフェクションによる導入に対応

設計バリエーション

CRISPRs +/- HDR

• IFRD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m）およびIFRD1 CRISPR/Cas9 KOプラスミド（m2）によってコードされるgRNAは、Ifrd1遺伝子座内の異なる部位を標的としています。いずれか一方、または両方の標的設計が利用可能な場合があります。入手可能性については「関連製品」を参照してください。
  IFRD1 HDRプラスミド（m）および IFRD1 HDRプラスミド（m2）によってコードされるHDRドナー構築体は、プロマイシン耐性カセットとRFPレポーターを含み、これらはIfrd1ホモロジーアームに挟まれており、CRISPR/Cas9 KO設計に対応する特定のIfrd1標的部位でのホモロジー依存修復をサポートします。HDRドナーの入手可能性は異なる場合があります。入手可能性については「関連製品」をご確認ください。

研究用のみ。診断用または治療用ではありません。