Emx1 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (m): sc-420169

Panoramica

EMX1 (empty spiracles homeobox 1) è un fattore di trascrizione homeobox di tipo paired-like che svolge un ruolo nella precoce definizione dei pattern del telencefalo e nell’arealizzazione della neocorteccia durante lo sviluppo embrionale del topo. Regola programmi di espressione genica che controllano la proliferazione dei progenitori neurali, la differenziazione neuronale e la laminazione corticale, integrandosi con reti di segnali di sviluppo come WNT/β-catenina e SHH, che definiscono l’identità regionale del prosencefalo. L’espressione di Emx1 è ampiamente utilizzata come marcatore delle linee del telencefalo dorsale, consentendo studi meccanicistici sulla corticogenesi e sull’assemblaggio dei circuiti. Reti trascrizionali associate a EMX1 deregolate sono rilevanti per fenotipi del neurosviluppo che influenzano la struttura cerebrale e la specificazione del destino di linea dei neuroni eccitatori.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO Emx1 (m) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene Emx1 in linee cellulari mouse. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del Emx1 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto Emx1 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina Emx1.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di Emx1 per lo studio della segnalazione di Emx1, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni Emx1 critici per la funzione di Emx1
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di Emx1 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal Emx1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m) e dal Emx1 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (m2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus Emx1. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal Emx1 Plasmide HDR (m) e il plasmide HDR Emx1 (m2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia Emx1 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio Emx1 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.