Cytokeratin 1 Plasmide di attivazione CRISPR (h): sc-400893-ACT

KRT1 codifica la citocheratina 1, una proteina di filamento intermedio di tipo II che forma un eterodimero con la cheratina 10 per costituire la rete cheratinica sovrabasale negli epiteli stratificati. Questo sistema di filamenti conferisce resilienza meccanica, sostiene l’adesione cellula-cellula associata ai desmosomi e partecipa ai programmi di differenziazione dei cheratinociti e di formazione della barriera. La dinamica della citocheratina 1 si integra con il rimodellamento del citoscheletro e con la segnalazione di risposta allo stress, influenzando l’integrità epiteliale durante la riparazione delle ferite e l’infiammazione. Un’espressione deregolata di KRT1 o un’organizzazione anomala dei filamenti di cheratina è associata a fenotipi di fragilità epidermica ed è spesso oggetto di studio in ricerche su ipercheratosi, difetti di cheratinizzazione e adattamento dello stress epiteliale.

Cytokeratin 1 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di KRT1 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.

Cytokeratin 1 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus KRT1 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.

Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione KRT1, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di Cytokeratin 1. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus KRT1 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da Cytokeratin 1 nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via Cytokeratin 1 nelle cellule tumorali con espressione di KRT1 silenziata o ridotta.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.