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ALKBH2 Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-407363-ACT | 20 µg | $397.00 |
ALKBH2 (AlkB homolog 2) è una diossigenasi dipendente da Fe(II)/2-ossoglutarato che ripara i danni da alchilazione nel DNA invertendo direttamente lesioni come la 1-metiladenina e la 3-metilcitosina. Ripristinando il normale appaiamento delle basi, ALKBH2 sostiene la stabilità del genoma durante la replicazione del DNA e si coordina con la riparazione per escissione di basi e con vie più ampie della risposta al danno al DNA. La sua attività è rilevante per le risposte cellulari ad agenti alchilanti endogeni e ambientali, collegando l’espressione di ALKBH2 al carico mutazionale e allo stress replicativo. Una regolazione alterata di ALKBH2 è stata studiata in contesti di biologia tumorale e di tolleranza al danno al DNA associata ai trattamenti, in cui cambiamenti nella capacità di riparazione possono influenzare i fenotipi di integrità genomica.
ALKBH2 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di ALKBH2 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
ALKBH2 Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus ALKBH2 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione ALKBH2, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di ALKBH2. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus ALKBH2 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da ALKBH2 nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via ALKBH2 nelle cellule tumorali con espressione di ALKBH2 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.