La forskolina eleva los niveles intracelulares de monofosfato de adenosina cíclico (AMPc), un segundo mensajero crítico en la señalización celular. Esta elevación puede provocar la activación de la proteína quinasa A (PKA) e influir en las proteínas reguladas por vías dependientes del AMPc. La ionomicina, un ionóforo del calcio, eleva los niveles de calcio intracelular, lo que a su vez puede activar las quinasas dependientes de la calmodulina, afectando potencialmente a las proteínas moduladas por la señalización del calcio.
La torina 1, un inhibidor específico de la diana de rapamicina en mamíferos (mTOR), induce la autofagia y, por tanto, puede influir en las proteínas asociadas a este proceso de reciclaje celular. Del mismo modo, la rapamicina se une a FKBP12 e inhibe mTOR, promoviendo también la autofagia y afectando posiblemente a proteínas relacionadas. El U0126, al inhibir MEK1/2, puede modular la vía de señalización de la cinasa regulada por señales extracelulares (ERK)/proteína cinasa activada por mitógenos (MAPK), que es fundamental en el control de diversos procesos celulares, como la proliferación y la diferenciación celular.
El estado de fosforilación es otro mecanismo regulador crucial en la actividad de las proteínas, y compuestos como la caliculina A y el ácido okadaico, que inhiben las proteínas fosfatasas 1 y 2A, pueden provocar un aumento de la fosforilación proteica, alterando potencialmente la actividad de las proteínas reguladas por estas modificaciones. Tanto laapsigargina como la tunicamicina inducen estrés en el retículo endoplásmico (RE): Thapsigargin al interrumpir el almacenamiento de calcio y Tunicamycin al obstaculizar la glicosilación ligada a N, lo que puede influir en las proteínas implicadas en la respuesta al estrés del RE y las vías asociadas. El BML-275 inhibe la señalización de la proteína morfogenética ósea (BMP) dirigiéndose a quinasas específicas, lo que puede influir en las proteínas asociadas a la vía de la BMP. El IBMX, un inhibidor no selectivo de la fosfodiesterasa, eleva los niveles de AMPc de forma similar a la forskolina, modulando así la actividad de las proteínas reguladas por la señalización del AMPc. La 2-Deoxi-D-glucosa, un análogo de la glucosa, inhibe la glucólisis y puede activar la proteína cinasa activada por AMP (AMPK), influyendo en las proteínas implicadas en la homeostasis energética celular.
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