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TM9SF4 Plasmide di attivazione CRISPR (h2) | sc-406168-ACT-2 | 20 µg | $397.00 |
Il gene umano TM9SF4 (transmembrane 9 superfamily member 4) codifica una proteina di membrana multipasso arricchita nei compartimenti endosomiali/lisosomiali, dove contribuisce al traffico vescicolare, all’acidificazione degli organelli e al turnover delle proteine di membrana. TM9SF4 è stato collegato alla regolazione dell’endocitosi e delle vie autofagia-lisosoma, influenzando l’omeostasi cellulare e le risposte allo stress attraverso il controllo del pH intracellulare e dello smistamento del carico. Alterazioni dell’espressione o della funzione di TM9SF4 sono state associate a fenotipi di sopravvivenza delle cellule tumorali e a contesti di segnalazione immuno-correlati, rendendolo rilevante per lo studio della biologia delle cellule tumorali e dell’adattamento al microambiente. L’editing genetico di TM9SF4 consente di indagare i meccanismi alla base della dinamica endolisosomiale, della proteostasi dipendente dal pH e degli effetti a valle sul riciclo dei recettori, sul sensing dei nutrienti e sulle transizioni di stato cellulare in modelli di cellule umane.
TM9SF4 Il plasmide di attivazione CRISPR (h2) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di TM9SF4 senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
TM9SF4 Il plasmide di attivazione CRISPR (h2) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus TM9SF4 nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione TM9SF4, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di TM9SF4. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus TM9SF4 nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da TM9SF4 nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via TM9SF4 nelle cellule tumorali con espressione di TM9SF4 silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.