Sox-8 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-406693

Panoramica

SOX8 codifica il fattore di trascrizione Sox-8, un membro della famiglia SOX (SRY-related HMG-box) che si lega al DNA tramite un dominio HMG per regolare la specificazione di linea e i programmi di differenziamento. Sox-8 partecipa a reti trascrizionali che controllano i derivati della cresta neurale, lo sviluppo di cellule gliali e oligodendrociti e aspetti della biologia gonadica e scheletrica, attraverso interazioni dipendenti dal contesto con cofattori e cromatina. Modulando programmi di espressione genica legati alle decisioni sul destino cellulare, alla proliferazione e al rimodellamento della matrice extracellulare, SOX8 contribuisce a vie di sviluppo e all’omeostasi dei tessuti. Un’espressione deregolata di SOX8 o un’alterazione dei circuiti della famiglia SOX è stata associata a stati trascrizionali oncogenici e ad anomalie dello sviluppo, a sostegno della sua rilevanza negli studi meccanicistici della regolazione genica correlata alle malattie.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO Sox-8 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene SOX8 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del SOX8 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto SOX8 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina Sox-8.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di SOX8 per lo studio della segnalazione di Sox-8, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni SOX8 critici per la funzione di Sox-8
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di SOX8 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal Sox-8 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal Sox-8 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus SOX8. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal Sox-8 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR Sox-8 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia SOX8 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio SOX8 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.