Sox-4 Plasmide KO CRISPR/Cas9 (h): sc-401217

Panoramica

SOX4 codifica il fattore di trascrizione Sox-4, una proteina legante il DNA del gruppo ad alta mobilità (HMG) che regola la specificazione di linea, la differenziazione e le decisioni sul destino cellulare durante lo sviluppo e l’omeostasi dei tessuti. Sox-4 partecipa a programmi trascrizionali collegati alle vie di segnalazione Wnt/β-catenina e TGF-β/SMAD e, a seconda del contesto cellulare, può influenzare la transizione epitelio-mesenchimale, il controllo del ciclo cellulare e l’apoptosi. Un’espressione alterata di SOX4 è stata associata a una deregolazione del mantenimento dei progenitori e a reti trascrizionali aberranti osservate in molteplici ambiti di ricerca oncologica e immunologica. In quanto regolatore nodale dell’espressione genica, Sox-4 è spesso studiato per i suoi effetti sui circuiti trascrizionali associati alla cromatina e sul cross-talk tra vie di segnalazione.

Il plasmide CRISPR/Cas9 KO Sox-4 (h) è un pool di plasmidi progettato per la distruzione mirata del gene SOX4 in linee cellulari human. Ciascun plasmide co-esprime un singolo RNA guida (sgRNA) unico che prende di mira un sito distinto all'interno del SOX4 insieme alla nucleasi Cas9 di Streptococcus pyogenes. I plasmidi codificano anche per la GFP, consentendo l'identificazione fluorescente e l'arricchimento delle cellule trasfettate con successo tramite microscopia a fluorescenza o citometria a flusso.

Il design multi-guida aumenta la probabilità di generare inserzioni o delezioni (indels) che interrompono il frame di lettura aperto SOX4 a seguito della formazione di rotture a doppio filamento mediate da Cas9. Le rotture del DNA introdotte dal sistema CRISPR/Cas9 vengono riparate attraverso vie endogene di giunzione non omologa (NHEJ), che spesso provocano mutazioni con spostamento del frame che annullano l'espressione della proteina Sox-4.

Questo sistema di knockout CRISPR consente la generazione efficiente di modelli cellulari carenti di SOX4 per lo studio della segnalazione di Sox-4, studi di genomica funzionale, ricerca sulla biologia del cancro e valutazione delle risposte terapeutiche in linee cellulari umane.

Caratteristiche principali

• sgRNA mirati agli esoni SOX4 critici per la funzione di Sox-4
  Co-espressione di SpCas9 e sgRNA da un singolo plasmide per una somministrazione semplificata
  Reporter GFP per l'identificazione delle cellule trasfettate
  Pool di plasmidi mirati a più siti genomici di SOX4 per migliorare l'efficienza del knockout
  Compatibile con la somministrazione tramite trasfezione

Varianti di progettazione

CRISPR +/- HDR

• Gli gRNA codificati dal Sox-4 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h) e dal Sox-4 CRISPR/Cas9 KO Plasmid (h2) prendono di mira siti distinti all'interno del locus SOX4. Potrebbe essere disponibile uno o entrambi i design di targeting. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.
  I costrutti donatori HDR codificati dal Sox-4 Plasmide HDR (h) e il plasmide HDR Sox-4 (h2) contengono una cassetta di resistenza alla puromicina e un reporter RFP affiancato da bracci di omologia SOX4 per supportare la riparazione diretta dall'omologia in siti bersaglio SOX4 definiti corrispondenti ai disegni CRISPR/Cas9 KO. La disponibilità dei donatori HDR può variare. Vedere Prodotti correlati per la disponibilità.

Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.