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SMPDL3B Plasmide di attivazione CRISPR (h) | sc-404724-ACT | 20 µg | $397.00 |
L’SMPDL3B umano (sphingomyelin phosphodiesterase acid-like 3B) codifica una proteina associata alla membrana ancorata tramite GPI, con omologia agli enzimi correlati alla sfingomielinasi, ed è implicata nella regolazione dell’omeostasi degli sfingolipidi e dei lipidi di membrana. Influenzando la composizione lipidica e l’organizzazione dei microdomini, SMPDL3B può modulare la segnalazione recettoriale, il traffico vescicolare e gli output di segnalazione dell’immunità innata in cellule mieloidi e in altri tipi cellulari. Un’espressione alterata di SMPDL3B è stata collegata in letteratura a fenotipi immunitari e infiammatori ed è stata studiata in contesti quali la biologia delle malattie renali e metaboliche, in cui il rimodellamento lipidico e la segnalazione immunitaria si intrecciano. Queste caratteristiche rendono SMPDL3B un bersaglio utile per studiare i meccanismi di segnalazione prossimi alla membrana e la regolazione, guidata dai lipidi, degli stati di attivazione cellulare.
SMPDL3B Il plasmide di attivazione CRISPR (h) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di SMPDL3B senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
SMPDL3B Il plasmide di attivazione CRISPR (h) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus SMPDL3B nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione SMPDL3B, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di SMPDL3B. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus SMPDL3B nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da SMPDL3B nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via SMPDL3B nelle cellule tumorali con espressione di SMPDL3B silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.