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LSD1 Plasmide di attivazione CRISPR (m) | sc-430289-ACT | 20 µg | $397.00 |
Il gene murino **Kdm1a** codifica la demetilasi 1 specifica per la lisina (LSD1/KDM1A), una demetilasi istonica dipendente da FAD che rimuove principalmente i segni H3K4me1/2 e H3K9me1/2 per modulare l’accessibilità della cromatina e i programmi trascrizionali. LSD1 agisce all’interno di complessi multiproteici repressori e attivatori, inclusi CoREST e NuRD, collegando il rimodellamento epigenetico alla regolazione genica dipendente dalla RNA polimerasi II durante lo sviluppo, l’impegno di linea e il controllo del ciclo cellulare. Modellando lo stato di enhancer e promotori, Kdm1a influenza vie che governano differenziamento, metabolismo e risposte allo stress in molteplici tessuti. Un’attività di LSD1 deregolata è ampiamente utilizzata come punto d’ingresso meccanicistico per studiare un’alterata regolazione epigenetica associata a stati trascrizionali oncogenici e a fenotipi neuroevolutivi in modelli sperimentali.
LSD1 Il plasmide di attivazione CRISPR (m) fornisce un approccio mirato e non distruttivo per sovraregolare l'espressione endogena di Kdm1a senza alterare la sequenza di DNA sottostante.
LSD1 Il plasmide di attivazione CRISPR (m) è un sistema SAM (mediatore di attivazione sinergico) a tre plasmidi progettato per la sovraregolazione trascrizionale altamente efficiente e sito-specifica del locus Kdm1a nelle linee cellulari umane. Il sistema è costruito attorno a una Cas9 cataliticamente inattiva (dCas9) che porta due mutazioni inattivanti (D10A e N863A) che eliminano l'attività nucleasica preservando al contempo il legame con il DNA. Questa dCas9 è fusa con VP64, un potente attivatore trascrizionale, ed è coespressa con un gene di resistenza alla blasticidina per la selezione. Il secondo plasmide codifica la proteina di fusione MS2-p65-HSF1, un complesso attivatore secondario che agisce in sinergia con dCas9-VP64, insieme a un gene di resistenza all'igromicina. Il terzo plasmide codifica un sgRNA specifico per il bersaglio di 20 nt fuso a due aptameri di RNA MS2 che reclutano il complesso MS2-p65-HSF1 nel sito di attivazione, accompagnato da un gene di resistenza alla puromicina. I tre plasmidi vengono somministrati in un rapporto di massa 1:1:1 per un'espressione bilanciata di tutti i componenti del sistema.
Una volta assemblato nel locus bersaglio, il complesso SAM si lega a circa 200 bp a monte del sito di inizio della trascrizione Kdm1a, dove VP64, p65 e HSF1 agiscono in modo concertato per reclutare il machinery trascrizionale e guidare la sovraregolazione dell'espressione endogena di LSD1. A differenza della Cas9 con attività nucleasica, dCas9 non introduce rotture a doppio filamento né modifica la sequenza genomica, preservando il locus Kdm1a nativo e consentendo lo studio delle risposte trascrizionali dipendenti da LSD1 nel locus endogeno, rendendolo uno strumento prezioso per studi funzionali, l'identificazione di geni bersaglio e la modellizzazione del ripristino della via LSD1 nelle cellule tumorali con espressione di Kdm1a silenziata o ridotta.
Solo per uso di ricerca. Non destinato a uso diagnostico o terapeutico.